La CER viene gestita da un soggetto in grado di svolgere tutte le funzioni richieste.

In particolare il gestore deve occuparsi di tutti gli aspetti tecnici ed amministrativi della CER, dei dati di consumo/produzione dei soci, dei rapporti con il GSE (Gestore Servizi Energetici) che eroga gli incentivi e può anche fornire supporto tecnico agli impianti.